تم انشاء جامعة جنوب الوادي الأهلية بموجب القرار الجمهوري رقم 420 لعام 2022 كخطوة للتوسع في مجال إتاحة التعليم العالي، وإتاحة فرص تعليمية جديدة لأبناء الوطن بالجامعات المصرية، والذي يسير وفق ما هو مخطط له، ويعتبر نموذجًا مميزًا على مستوى هذا النوع من المشروعات القومية. ،
وتقع داخل الحرم الجامعي الرئيسي لجامعة جنوب الوادي، على مساحة 41 فدانا أي نحو (172200) متر مربع في الجزء الشمالي الشرقي من الحرم الجامعي، ولها سور وبوابة مستقلة على طريق "قنا � سفاجا السياحي"، وملاصقة للمدينة الطبية بالجامعة الأم .
وفي إطار القرار الوزاري رقم 4079 وتاريخ 2 أكتوبر 2022م الصادر من وزير التعليم العالي والبحث العلمي استناداً قانون الجامعات الخاصة والأهلية رقم 12 لسنة 2009 وتعديلاته ولائحتهما التنفيذية، وعلى قرار رئيس الجمهورية السابق بشأن إنشاء جامعة جنوب الوادي الأهلية، وعلى قرار مجلس الجامعات الأهلية رقم 4 وتاريخ 27 سبتمبر 2022م،قرر التصريح ببدء الدراسة بكلية الطب والجراحة بجامعة جنوب الوادي الأهلية اعتباراً من الفصل الدراسي الأول للعام الجامعي 2022/2023م
